Идем в раздел:

HKEY_CLASSES_ROOT\SystemFileAssociations\image\shell\edit\command

По умолчанию, там:

"%systemroot%\system32\mspaint.exe" "%1"

Меняем, например, на:

"%ProgramFiles%\paint.net\PaintDotNet.exe" "%1"

Источник
Перечень системных переменных среды окружения (пример: %ProgramFiles%) можно узнать с помощью команды set, запустив ее из утилиты командной строки cmd.exe
Источник
To set Microsoft Store paint.net a default image editor